蛋白實(shí)驗(yàn)檢測常見問題及解答
問題1:為什么選擇內(nèi)參?
內(nèi)參也叫看家基因,在組織或細(xì)胞中都會表達(dá),且表達(dá)量在不同組織或細(xì)胞中幾乎是相同的,一般有α-Tublin,β-actin,GAPDH等,在WesternBlotting中使用內(nèi)參其實(shí)就是在WB過程中的另外用內(nèi)參對應(yīng)的抗體檢測內(nèi)參。其作用有二:
1.是看提取蛋白質(zhì)量的好壞。如果做western的時候,內(nèi)參照蛋白有條帶,而目的蛋白沒有,說明蛋白的提取和轉(zhuǎn)膜等步驟沒有問題,是目的蛋白的抗體質(zhì)量不好或者是稀釋倍數(shù)不對。
2.是比較客觀的說明目的蛋白的表達(dá)情況,消除上樣量等的誤差。不同的樣品之間由于蛋白提取的量有差別,可能強(qiáng)陽性的表達(dá)跑出來的帶很弱。因此設(shè)立內(nèi)參照,比較不同樣品之間的表達(dá)情況。
問題2:為什么檢測的背景比較高?
1.可能抗體濃度濃度較高。
2.抗原量較大。
3.一張膜中有的目的條帶較弱,為了能讓較弱條帶顯示出來,曝光時間較長。
問題3:為什么檢測無信號?(白板)
大概總結(jié)為以下幾類原因:
1.樣品中目的蛋白豐度很低,低于實(shí)驗(yàn)的檢測下限。
3.蛋白降解。
4.待測樣品的確為陰性。
5.一抗失效。
6.抗原量不足,每泳道蛋白上樣量不低于0.1ug。
問題4:為什么檢測的結(jié)果分子量大小與實(shí)際不符?
1.翻譯后修飾-比如蛋白的磷酸化,糖基化等,這些都會增加蛋白的分子量大小。
2.翻譯后剪切-比如很多蛋白首先被合成為前體形式,然后通過剪切獲得生物學(xué)活性。
3.剪切變異體-相同的基因,經(jīng)過選擇性剪接會產(chǎn)生不同分子量大小的蛋白。
4.相對電荷-氨基酸的組成(帶電vs不帶電)。
5.多聚體-比如蛋白二聚體。
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